Program księgowości internetowej mKsiegowa.pl posiada zintegrowany moduł gospodarki wielo-magazynowej.
Oznacza to, że można rozliczać gospodarkę magazynową za pomocą tzw. logicznych magazynów. Lokalizacje magazynów mogą być związane z konkretnymi magazynami fizycznymi lub tylko reprezentować wydzielony obszar gospodarki magazynowej, jak np.: remanent, magazyn zwrotów, itp.
Domyślny magazyn można ustawić dla każdego klienta w oddziałach klientów.